扁桃体炎是可以引起肾小球肾炎的，发病机制考虑和黏膜的免疫反应相关，呼吸道黏膜的感染可以导致免疫反应的发生，可以导致免疫复合物沉积于肾脏，从而激活了补体途径，而导致肾脏的损伤，引发肾炎的发作。
扁桃体淋巴组织存在很多异常糖基化iga1分子，干细胞是没有办法将其清除的，iga1分子在循环中大多以免疫复合物的形式而存在，此种免疫复合物随着血液循环到达了肾脏，可以沉积在肾小球的系膜区，沉积之后可以刺激局部的反应，刺激系膜细胞的增殖，促进分泌系膜机制、细胞因子等成分，从而导致了肾小球肾炎的发生。
所以肾炎的患者对于感染是需要引起高度重视的，因为感染可能会诱发和加重肾炎，需要引起患者高度的重视。如果出现了扁桃体炎是需要给予积极治疗的。