肾小球肾炎和肾盂肾炎是两个完全不同的疾病，其发病原因临床表现以及治疗均是不相同的。
第一，肾盂肾炎，肾盂肾炎本质上是感染性疾病属于上尿路的感染，病变的部位是在肾盂，最常见的是细菌感染而引起的，比如大肠杆菌，患者会有明显的发热、寒颤、尿路刺激症状，比如尿频、尿急、尿痛等相关的表现，病人还会有腰痛、肾区叩痛等相关表现。治疗是需要应用抗生素来治疗的，可选的抗生素，比如头孢类的或者是喹诺酮类的药物。
第二，肾小球肾炎，肾小球肾炎的病变部位是在肾脏，可以分为急性肾小球肾炎、慢性肾小球肾炎、急进性肾小球肾炎和隐匿性肾小球肾炎等等，肾炎的发病主要和免疫反应有关系，临床表现为血尿、蛋白尿、高血压、水肿，伴有或者不伴有肾功能的减退，在治疗方面除了急性肾小球肾炎，需要应用抗生素治疗之外，其他都是不需要的。要根据疾病的严重程度以及肾穿刺病理的情况决定治疗，有些患者可能会应用糖皮质激素等类的免疫抑制治疗。